Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms