Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLDN25C9JDP6 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLDN25C9JDP6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLDN25C9JDP6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLDN25C9JDP6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLDN25C9JDP6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLDN25C9JDP6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLDN25C9JDP6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLDN25C9JDP6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLDN25C9JDP6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLDN25C9JDP6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLDN25C9JDP6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CLDN25C9JDP6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLDN25C9JDP6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDN25C9JDP6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CLDN25C9JDP6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLDN25C9JDP6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CLDN25C9JDP6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CLDN25C9JDP6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDN25C9JDP6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CLDN25C9JDP6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CLDN25C9JDP6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN25C9JDP6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN25C9JDP6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CLDN25C9JDP6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN25C9JDP6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN25C9JDP6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CLDN25C9JDP6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDN25C9JDP6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CLDN25C9JDP6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN25C9JDP6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CLDN25C9JDP6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLDN25C9JDP6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN25C9JDP6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLDN25C9JDP6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN25C9JDP6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN25C9JDP6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CLDN25C9JDP6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN25C9JDP6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN25C9JDP6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN25C9JDP6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN25C9JDP6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN25C9JDP6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN25C9JDP6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN25C9JDP6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN25C9JDP6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN25C9JDP6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN25C9JDP6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN25C9JDP6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN25C9JDP6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN25C9JDP6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CLDN25C9JDP6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CLDN25C9JDP6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN25C9JDP6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLDN25C9JDP6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CLDN25C9JDP6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN25C9JDP6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLDN25C9JDP6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN25C9JDP6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CLDN25C9JDP6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CLDN25C9JDP6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CLDN25C9JDP6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CLDN25C9JDP6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN25C9JDP6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN25C9JDP6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CLDN25C9JDP6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN25C9JDP6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CLDN25C9JDP6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLDN25C9JDP6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN25C9JDP6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLDN25C9JDP6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN25C9JDP6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CLDN25C9JDP6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN25C9JDP6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CLDN25C9JDP6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN25C9JDP6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN25C9JDP6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLDN25C9JDP6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLDN25C9JDP6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CLDN25C9JDP6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN25C9JDP6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CLDN25C9JDP6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CLDN25C9JDP6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLDN25C9JDP6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CLDN25C9JDP6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN25C9JDP6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLDN25C9JDP6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN25C9JDP6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLDN25C9JDP6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLDN25C9JDP6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLDN25C9JDP6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLDN25C9JDP6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLDN25C9JDP6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLDN25C9JDP6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CLDN25C9JDP6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLDN25C9JDP6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLDN25C9JDP6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN25C9JDP6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN25C9JDP6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLDN25C9JDP6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms