Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOTOA8MTQ0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOTOA8MTQ0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOTOA8MTQ0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOTOA8MTQ0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOTOA8MTQ0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOTOA8MTQ0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOTOA8MTQ0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOTOA8MTQ0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NOTOA8MTQ0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOTOA8MTQ0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOTOA8MTQ0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOTOA8MTQ0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOTOA8MTQ0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOTOA8MTQ0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NOTOA8MTQ0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NOTOA8MTQ0 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOTOA8MTQ0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NOTOA8MTQ0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NOTOA8MTQ0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NOTOA8MTQ0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NOTOA8MTQ0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NOTOA8MTQ0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NOTOA8MTQ0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NOTOA8MTQ0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NOTOA8MTQ0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NOTOA8MTQ0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NOTOA8MTQ0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NOTOA8MTQ0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOTOA8MTQ0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NOTOA8MTQ0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NOTOA8MTQ0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NOTOA8MTQ0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NOTOA8MTQ0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NOTOA8MTQ0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NOTOA8MTQ0 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOTOA8MTQ0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NOTOA8MTQ0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NOTOA8MTQ0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NOTOA8MTQ0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOTOA8MTQ0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NOTOA8MTQ0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOTOA8MTQ0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NOTOA8MTQ0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NOTOA8MTQ0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NOTOA8MTQ0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOTOA8MTQ0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NOTOA8MTQ0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOTOA8MTQ0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOTOA8MTQ0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOTOA8MTQ0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NOTOA8MTQ0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOTOA8MTQ0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOTOA8MTQ0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOTOA8MTQ0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NOTOA8MTQ0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NOTOA8MTQ0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NOTOA8MTQ0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NOTOA8MTQ0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOTOA8MTQ0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NOTOA8MTQ0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOTOA8MTQ0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOTOA8MTQ0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NOTOA8MTQ0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOTOA8MTQ0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOTOA8MTQ0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NOTOA8MTQ0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOTOA8MTQ0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NOTOA8MTQ0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NOTOA8MTQ0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NOTOA8MTQ0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NOTOA8MTQ0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOTOA8MTQ0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NOTOA8MTQ0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOTOA8MTQ0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NOTOA8MTQ0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOTOA8MTQ0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOTOA8MTQ0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NOTOA8MTQ0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NOTOA8MTQ0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOTOA8MTQ0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NOTOA8MTQ0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NOTOA8MTQ0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NOTOA8MTQ0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NOTOA8MTQ0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOTOA8MTQ0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NOTOA8MTQ0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NOTOA8MTQ0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOTOA8MTQ0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NOTOA8MTQ0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NOTOA8MTQ0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOTOA8MTQ0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NOTOA8MTQ0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NOTOA8MTQ0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NOTOA8MTQ0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOTOA8MTQ0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOTOA8MTQ0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NOTOA8MTQ0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOTOA8MTQ0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NOTOA8MTQ0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms