Protein–RNA interactions for Protein: A0A0K0K1G6

TRBV10-3, T-cell receptor beta variable 10-3 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRBV10-3A0A0K0K1G6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRBV10-3A0A0K0K1G6 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRBV10-3A0A0K0K1G6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRBV10-3A0A0K0K1G6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TRBV10-3A0A0K0K1G6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TRBV10-3A0A0K0K1G6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRBV10-3A0A0K0K1G6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRBV10-3A0A0K0K1G6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRBV10-3A0A0K0K1G6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRBV10-3A0A0K0K1G6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRBV10-3A0A0K0K1G6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRBV10-3A0A0K0K1G6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRBV10-3A0A0K0K1G6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRBV10-3A0A0K0K1G6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRBV10-3A0A0K0K1G6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRBV10-3A0A0K0K1G6 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRBV10-3A0A0K0K1G6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRBV10-3A0A0K0K1G6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRBV10-3A0A0K0K1G6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRBV10-3A0A0K0K1G6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRBV10-3A0A0K0K1G6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRBV10-3A0A0K0K1G6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TRBV10-3A0A0K0K1G6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRBV10-3A0A0K0K1G6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TRBV10-3A0A0K0K1G6 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRBV10-3A0A0K0K1G6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRBV10-3A0A0K0K1G6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TRBV10-3A0A0K0K1G6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV10-3A0A0K0K1G6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV10-3A0A0K0K1G6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV10-3A0A0K0K1G6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TRBV10-3A0A0K0K1G6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRBV10-3A0A0K0K1G6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRBV10-3A0A0K0K1G6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TRBV10-3A0A0K0K1G6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRBV10-3A0A0K0K1G6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TRBV10-3A0A0K0K1G6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
TRBV10-3A0A0K0K1G6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
TRBV10-3A0A0K0K1G6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRBV10-3A0A0K0K1G6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
TRBV10-3A0A0K0K1G6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
TRBV10-3A0A0K0K1G6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
TRBV10-3A0A0K0K1G6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms