Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J264

TRAV38-1, T-cell receptor alpha variable 38-1 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV38-1A0A0B4J264 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAV38-1A0A0B4J264 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRAV38-1A0A0B4J264 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRAV38-1A0A0B4J264 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRAV38-1A0A0B4J264 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRAV38-1A0A0B4J264 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAV38-1A0A0B4J264 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAV38-1A0A0B4J264 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRAV38-1A0A0B4J264 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRAV38-1A0A0B4J264 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRAV38-1A0A0B4J264 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAV38-1A0A0B4J264 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAV38-1A0A0B4J264 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAV38-1A0A0B4J264 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRAV38-1A0A0B4J264 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRAV38-1A0A0B4J264 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAV38-1A0A0B4J264 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRAV38-1A0A0B4J264 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAV38-1A0A0B4J264 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAV38-1A0A0B4J264 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRAV38-1A0A0B4J264 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRAV38-1A0A0B4J264 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TRAV38-1A0A0B4J264 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRAV38-1A0A0B4J264 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAV38-1A0A0B4J264 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAV38-1A0A0B4J264 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRAV38-1A0A0B4J264 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAV38-1A0A0B4J264 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAV38-1A0A0B4J264 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRAV38-1A0A0B4J264 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRAV38-1A0A0B4J264 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAV38-1A0A0B4J264 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRAV38-1A0A0B4J264 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAV38-1A0A0B4J264 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TRAV38-1A0A0B4J264 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRAV38-1A0A0B4J264 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAV38-1A0A0B4J264 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAV38-1A0A0B4J264 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAV38-1A0A0B4J264 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAV38-1A0A0B4J264 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRAV38-1A0A0B4J264 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAV38-1A0A0B4J264 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRAV38-1A0A0B4J264 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAV38-1A0A0B4J264 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAV38-1A0A0B4J264 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAV38-1A0A0B4J264 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAV38-1A0A0B4J264 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAV38-1A0A0B4J264 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAV38-1A0A0B4J264 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAV38-1A0A0B4J264 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAV38-1A0A0B4J264 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAV38-1A0A0B4J264 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAV38-1A0A0B4J264 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAV38-1A0A0B4J264 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAV38-1A0A0B4J264 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAV38-1A0A0B4J264 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAV38-1A0A0B4J264 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAV38-1A0A0B4J264 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAV38-1A0A0B4J264 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAV38-1A0A0B4J264 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAV38-1A0A0B4J264 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAV38-1A0A0B4J264 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAV38-1A0A0B4J264 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAV38-1A0A0B4J264 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAV38-1A0A0B4J264 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAV38-1A0A0B4J264 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAV38-1A0A0B4J264 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAV38-1A0A0B4J264 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAV38-1A0A0B4J264 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAV38-1A0A0B4J264 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAV38-1A0A0B4J264 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAV38-1A0A0B4J264 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAV38-1A0A0B4J264 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAV38-1A0A0B4J264 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAV38-1A0A0B4J264 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRAV38-1A0A0B4J264 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAV38-1A0A0B4J264 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAV38-1A0A0B4J264 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAV38-1A0A0B4J264 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAV38-1A0A0B4J264 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAV38-1A0A0B4J264 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAV38-1A0A0B4J264 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAV38-1A0A0B4J264 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAV38-1A0A0B4J264 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAV38-1A0A0B4J264 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRAV38-1A0A0B4J264 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAV38-1A0A0B4J264 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAV38-1A0A0B4J264 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAV38-1A0A0B4J264 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAV38-1A0A0B4J264 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAV38-1A0A0B4J264 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAV38-1A0A0B4J264 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAV38-1A0A0B4J264 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAV38-1A0A0B4J264 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAV38-1A0A0B4J264 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAV38-1A0A0B4J264 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAV38-1A0A0B4J264 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAV38-1A0A0B4J264 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAV38-1A0A0B4J264 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRAV38-1A0A0B4J264 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms