Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1R7

BORCS7-ASMT, BORCS7-ASMT readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms