Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS04

TRBV6-7, T-cell receptor beta variable 6-7 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV6-7A0A0A0MS04 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRBV6-7A0A0A0MS04 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRBV6-7A0A0A0MS04 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRBV6-7A0A0A0MS04 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRBV6-7A0A0A0MS04 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRBV6-7A0A0A0MS04 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRBV6-7A0A0A0MS04 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRBV6-7A0A0A0MS04 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRBV6-7A0A0A0MS04 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBV6-7A0A0A0MS04 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRBV6-7A0A0A0MS04 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRBV6-7A0A0A0MS04 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRBV6-7A0A0A0MS04 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRBV6-7A0A0A0MS04 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRBV6-7A0A0A0MS04 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRBV6-7A0A0A0MS04 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRBV6-7A0A0A0MS04 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRBV6-7A0A0A0MS04 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRBV6-7A0A0A0MS04 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRBV6-7A0A0A0MS04 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TRBV6-7A0A0A0MS04 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRBV6-7A0A0A0MS04 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TRBV6-7A0A0A0MS04 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRBV6-7A0A0A0MS04 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TRBV6-7A0A0A0MS04 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TRBV6-7A0A0A0MS04 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TRBV6-7A0A0A0MS04 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TRBV6-7A0A0A0MS04 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TRBV6-7A0A0A0MS04 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRBV6-7A0A0A0MS04 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRBV6-7A0A0A0MS04 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TRBV6-7A0A0A0MS04 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TRBV6-7A0A0A0MS04 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRBV6-7A0A0A0MS04 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRBV6-7A0A0A0MS04 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRBV6-7A0A0A0MS04 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRBV6-7A0A0A0MS04 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRBV6-7A0A0A0MS04 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRBV6-7A0A0A0MS04 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRBV6-7A0A0A0MS04 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRBV6-7A0A0A0MS04 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBV6-7A0A0A0MS04 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRBV6-7A0A0A0MS04 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRBV6-7A0A0A0MS04 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRBV6-7A0A0A0MS04 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRBV6-7A0A0A0MS04 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRBV6-7A0A0A0MS04 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRBV6-7A0A0A0MS04 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRBV6-7A0A0A0MS04 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRBV6-7A0A0A0MS04 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBV6-7A0A0A0MS04 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRBV6-7A0A0A0MS04 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRBV6-7A0A0A0MS04 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRBV6-7A0A0A0MS04 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRBV6-7A0A0A0MS04 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBV6-7A0A0A0MS04 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBV6-7A0A0A0MS04 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBV6-7A0A0A0MS04 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRBV6-7A0A0A0MS04 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRBV6-7A0A0A0MS04 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRBV6-7A0A0A0MS04 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRBV6-7A0A0A0MS04 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBV6-7A0A0A0MS04 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRBV6-7A0A0A0MS04 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRBV6-7A0A0A0MS04 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRBV6-7A0A0A0MS04 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRBV6-7A0A0A0MS04 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRBV6-7A0A0A0MS04 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRBV6-7A0A0A0MS04 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRBV6-7A0A0A0MS04 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRBV6-7A0A0A0MS04 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRBV6-7A0A0A0MS04 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRBV6-7A0A0A0MS04 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRBV6-7A0A0A0MS04 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRBV6-7A0A0A0MS04 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRBV6-7A0A0A0MS04 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRBV6-7A0A0A0MS04 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRBV6-7A0A0A0MS04 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRBV6-7A0A0A0MS04 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRBV6-7A0A0A0MS04 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRBV6-7A0A0A0MS04 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRBV6-7A0A0A0MS04 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRBV6-7A0A0A0MS04 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRBV6-7A0A0A0MS04 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRBV6-7A0A0A0MS04 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRBV6-7A0A0A0MS04 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRBV6-7A0A0A0MS04 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRBV6-7A0A0A0MS04 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRBV6-7A0A0A0MS04 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRBV6-7A0A0A0MS04 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRBV6-7A0A0A0MS04 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRBV6-7A0A0A0MS04 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRBV6-7A0A0A0MS04 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRBV6-7A0A0A0MS04 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
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