Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WX78

ELOA3C, Putative elongin-A3 member C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELOA3CA0A087WX78 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ELOA3CA0A087WX78 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ELOA3CA0A087WX78 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELOA3CA0A087WX78 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ELOA3CA0A087WX78 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ELOA3CA0A087WX78 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ELOA3CA0A087WX78 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ELOA3CA0A087WX78 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ELOA3CA0A087WX78 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELOA3CA0A087WX78 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ELOA3CA0A087WX78 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ELOA3CA0A087WX78 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ELOA3CA0A087WX78 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ELOA3CA0A087WX78 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELOA3CA0A087WX78 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ELOA3CA0A087WX78 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ELOA3CA0A087WX78 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ELOA3CA0A087WX78 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ELOA3CA0A087WX78 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ELOA3CA0A087WX78 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ELOA3CA0A087WX78 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ELOA3CA0A087WX78 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ELOA3CA0A087WX78 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ELOA3CA0A087WX78 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ELOA3CA0A087WX78 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ELOA3CA0A087WX78 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ELOA3CA0A087WX78 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELOA3CA0A087WX78 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELOA3CA0A087WX78 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELOA3CA0A087WX78 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELOA3CA0A087WX78 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELOA3CA0A087WX78 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELOA3CA0A087WX78 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ELOA3CA0A087WX78 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELOA3CA0A087WX78 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ELOA3CA0A087WX78 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ELOA3CA0A087WX78 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELOA3CA0A087WX78 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ELOA3CA0A087WX78 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELOA3CA0A087WX78 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ELOA3CA0A087WX78 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ELOA3CA0A087WX78 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ELOA3CA0A087WX78 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ELOA3CA0A087WX78 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ELOA3CA0A087WX78 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELOA3CA0A087WX78 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ELOA3CA0A087WX78 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ELOA3CA0A087WX78 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELOA3CA0A087WX78 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ELOA3CA0A087WX78 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ELOA3CA0A087WX78 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ELOA3CA0A087WX78 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELOA3CA0A087WX78 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ELOA3CA0A087WX78 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELOA3CA0A087WX78 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELOA3CA0A087WX78 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ELOA3CA0A087WX78 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ELOA3CA0A087WX78 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELOA3CA0A087WX78 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ELOA3CA0A087WX78 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELOA3CA0A087WX78 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ELOA3CA0A087WX78 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELOA3CA0A087WX78 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELOA3CA0A087WX78 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ELOA3CA0A087WX78 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELOA3CA0A087WX78 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ELOA3CA0A087WX78 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELOA3CA0A087WX78 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ELOA3CA0A087WX78 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELOA3CA0A087WX78 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELOA3CA0A087WX78 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELOA3CA0A087WX78 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ELOA3CA0A087WX78 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ELOA3CA0A087WX78 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ELOA3CA0A087WX78 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ELOA3CA0A087WX78 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELOA3CA0A087WX78 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELOA3CA0A087WX78 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ELOA3CA0A087WX78 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ELOA3CA0A087WX78 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELOA3CA0A087WX78 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELOA3CA0A087WX78 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELOA3CA0A087WX78 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ELOA3CA0A087WX78 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ELOA3CA0A087WX78 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ELOA3CA0A087WX78 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ELOA3CA0A087WX78 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ELOA3CA0A087WX78 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELOA3CA0A087WX78 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELOA3CA0A087WX78 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ELOA3CA0A087WX78 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ELOA3CA0A087WX78 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELOA3CA0A087WX78 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ELOA3CA0A087WX78 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ELOA3CA0A087WX78 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELOA3CA0A087WX78 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ELOA3CA0A087WX78 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELOA3CA0A087WX78 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ELOA3CA0A087WX78 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ELOA3CA0A087WX78 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms