Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WVE0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WVE0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A0A087WVE0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A0A087WVE0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A0A087WVE0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A0A087WVE0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A087WVE0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A087WVE0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A0A087WVE0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A087WVE0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A087WVE0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A0A087WVE0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
A0A087WVE0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A087WVE0 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A087WVE0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A087WVE0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A0A087WVE0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A087WVE0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A0A087WVE0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A087WVE0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A0A087WVE0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A0A087WVE0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A087WVE0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A0A087WVE0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A087WVE0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A0A087WVE0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
A0A087WVE0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
A0A087WVE0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A0A087WVE0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A0A087WVE0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A0A087WVE0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
A0A087WVE0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A0A087WVE0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A0A087WVE0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A0A087WVE0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
A0A087WVE0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
A0A087WVE0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
A0A087WVE0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A0A087WVE0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
A0A087WVE0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
A0A087WVE0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
A0A087WVE0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A0A087WVE0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
A0A087WVE0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
A0A087WVE0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
A0A087WVE0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
A0A087WVE0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
A0A087WVE0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A087WVE0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A087WVE0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
A0A087WVE0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A087WVE0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A087WVE0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A087WVE0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
A0A087WVE0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
A0A087WVE0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A0A087WVE0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
A0A087WVE0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
A0A087WVE0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A0A087WVE0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A0A087WVE0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A0A087WVE0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
A0A087WVE0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
A0A087WVE0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
A0A087WVE0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
A0A087WVE0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A0A087WVE0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
A0A087WVE0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
A0A087WVE0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
A0A087WVE0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
A0A087WVE0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
A0A087WVE0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
A0A087WVE0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
A0A087WVE0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
A0A087WVE0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A087WVE0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A087WVE0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
A0A087WVE0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A087WVE0 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A087WVE0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
A0A087WVE0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A087WVE0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A087WVE0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
A0A087WVE0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A087WVE0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A087WVE0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A087WVE0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
A0A087WVE0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A0A087WVE0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
A0A087WVE0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
A0A087WVE0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
A0A087WVE0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
A0A087WVE0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
A0A087WVE0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
A0A087WVE0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A0A087WVE0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
A0A087WVE0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
A0A087WVE0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
A0A087WVE0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
A0A087WVE0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
A0A087WVE0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms