Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KDM2AQ9Y2K7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms