Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VPS29Q9UBQ0 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS29Q9UBQ0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms