Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M3

LLGL2, Lethal(2) giant larvae protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LLGL2Q6P1M3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
LLGL2Q6P1M3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LLGL2Q6P1M3 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms