Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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SP6Q3SY56 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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SP6Q3SY56 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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SP6Q3SY56 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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SP6Q3SY56 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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SP6Q3SY56 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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SP6Q3SY56 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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SP6Q3SY56 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SP6Q3SY56 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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