Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
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