Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PUM3Q15397 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PUM3Q15397 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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