Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HERC3Q15034 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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