Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SMC1AQ14683 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
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