Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
HBBP68871 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
HBBP68871 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms