Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 CHL1-201ENST00000256509 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 DLGAP1-203ENST00000400147 5258 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 DLGAP1-206ENST00000400155 5257 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 MYO9B-204ENST00000594824 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
HERVK_113P61574 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms