Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
THOP1P52888 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
THOP1P52888 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THOP1P52888 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
THOP1P52888 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THOP1P52888 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THOP1P52888 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
THOP1P52888 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THOP1P52888 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THOP1P52888 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
THOP1P52888 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THOP1P52888 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THOP1P52888 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THOP1P52888 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THOP1P52888 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
THOP1P52888 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THOP1P52888 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
THOP1P52888 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
THOP1P52888 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THOP1P52888 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
THOP1P52888 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THOP1P52888 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
THOP1P52888 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THOP1P52888 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THOP1P52888 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
THOP1P52888 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THOP1P52888 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THOP1P52888 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
THOP1P52888 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THOP1P52888 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
THOP1P52888 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
THOP1P52888 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
THOP1P52888 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
THOP1P52888 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
THOP1P52888 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
THOP1P52888 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
THOP1P52888 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
THOP1P52888 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
THOP1P52888 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
THOP1P52888 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
THOP1P52888 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
THOP1P52888 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
THOP1P52888 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
THOP1P52888 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
THOP1P52888 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
THOP1P52888 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
THOP1P52888 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
THOP1P52888 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
THOP1P52888 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
THOP1P52888 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
THOP1P52888 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
THOP1P52888 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
THOP1P52888 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
THOP1P52888 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
THOP1P52888 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
THOP1P52888 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
THOP1P52888 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
THOP1P52888 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
THOP1P52888 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.5 ms