Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms