Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
USP29Q9HBJ7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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