Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
HIGD2AQ9BW72 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms