Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC9

VMP1, Vacuole membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMP1Q96GC9 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VMP1Q96GC9 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms