Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
LMNTD2Q8IXW0 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms