Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRADDQ15628 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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