Protein–RNA interactions for Protein: Q13772

NCOA4, Nuclear receptor coactivator 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA4Q13772 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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NCOA4Q13772 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
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NCOA4Q13772 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NCOA4Q13772 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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