Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CDH18Q13634 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CDH18Q13634 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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