Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DNASE1L3Q13609 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms