Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PEX6Q13608 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PEX6Q13608 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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