Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NAE1Q13564 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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NAE1Q13564 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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NAE1Q13564 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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NAE1Q13564 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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NAE1Q13564 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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NAE1Q13564 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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NAE1Q13564 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NAE1Q13564 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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