Protein–RNA interactions for Protein: Q09013

DMPK, Myotonin-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMPKQ09013 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DMPKQ09013 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms