Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
HOXA5P20719 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA5P20719 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA5P20719 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA5P20719 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA5P20719 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA5P20719 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA5P20719 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA5P20719 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA5P20719 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA5P20719 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA5P20719 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA5P20719 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
HOXA5P20719 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms