Protein–RNA interactions for Protein: A6NL46

Putative UPF0607 protein ENSP00000332738, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NL46 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A6NL46 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A6NL46 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A6NL46 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
A6NL46 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A6NL46 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
A6NL46 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
A6NL46 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
A6NL46 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A6NL46 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
A6NL46 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
A6NL46 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms