Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2S6

TMA7, Translation machinery-associated protein 7, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 64 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMA7Q9Y2S6 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 DDR1-262ENST00000508312 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 PCMTD1-208ENST00000544451 3697 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 APOBR-201ENST00000431282 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 CCT3-204ENST00000368259 1815 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 ST6GAL2-201ENST00000361686 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 LITAF-221ENST00000622633 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 CAPN13-201ENST00000295055 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 LOXL3-204ENST00000409549 2897 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 TVP23A-201ENST00000299866 3360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 AC012313.8-201ENST00000595059 5402 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 MTMR3-201ENST00000323630 5866 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 CACNG3-201ENST00000005284 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 PIGN-226ENST00000638591 2776 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 PRAM1-201ENST00000423345 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 GRAMD1B-202ENST00000450171 2431 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 HERC2P10-201ENST00000570209 2393 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 AC134772.2-202ENST00000634384 3585 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 CPN2-201ENST00000323830 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 ABCA2-202ENST00000341511 8063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMA7Q9Y2S6 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms