Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCDHA12Q9UN75 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCDHA12Q9UN75 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCDHA12Q9UN75 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCDHA12Q9UN75 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCDHA12Q9UN75 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PCDHA12Q9UN75 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCDHA12Q9UN75 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCDHA12Q9UN75 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PCDHA12Q9UN75 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PCDHA12Q9UN75 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms