Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPASTQ9UBP0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms