Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms