Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms