Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
MCOLN3Q8TDD5 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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