Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFD5

ARID1B, AT-rich interactive domain-containing protein 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1BQ8NFD5 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ARID1BQ8NFD5 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms