Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF548Q8NEK5 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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