Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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ZNF439Q8NDP4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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ZNF439Q8NDP4 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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ZNF439Q8NDP4 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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ZNF439Q8NDP4 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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ZNF439Q8NDP4 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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ZNF439Q8NDP4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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ZNF439Q8NDP4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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ZNF439Q8NDP4 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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ZNF439Q8NDP4 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ZNF439Q8NDP4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
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