Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ANKRD54Q6NXT1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms