Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GEN1Q17RS7 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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GEN1Q17RS7 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GEN1Q17RS7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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