Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPROQ16827 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms