Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PDK4Q16654 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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