Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
TAF13Q15543 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms