Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CCNIQ14094 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms