Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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CUL4AQ13619 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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CUL4AQ13619 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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CUL4AQ13619 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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CUL4AQ13619 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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CUL4AQ13619 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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CUL4AQ13619 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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CUL4AQ13619 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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CUL4AQ13619 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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CUL4AQ13619 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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CUL4AQ13619 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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CUL4AQ13619 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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CUL4AQ13619 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CUL4AQ13619 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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